Madrasah Tsanawiyah Negeri Surabaya I merupakan lembaga pendidikan dibawah naungan Kementerian Agama yang didirikan berdasarkan Surat Keputusan Menteri Agama Nomor. 27 Tanggal, 31 Mei 1980. Ketetapan itu sebagai tindak lanjut dengan adanya relokasi dari MTsN Mrican Kediri, menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri I Surabaya.

Kepala Madrasah yang pernah memimpin MTsN I Surabaya:

TAHUN 1980-1990: Bpk. Drs. H. Badruzzaman

TAHUN 1991-1998: Bpk. Drs. H. Tamam Sirajuddin. 

TAHUN 1999-2003: Bpk. Drs. H. Rostam

TAHUN 2003-2008: Bpk. Drs. H. Nasrip Ibrahim

TAHUN 2008-2010: Bpk. H. Fathul Yaqien, S.Pd.

TAHUN 2010-2014: Bpk. Drs. H. Saoedjan Dihanto, MM.

TAHUN 2014-2016: Ibu. Dra. Hj. Enik Eri Purwaty.

TAHUN 2016-Sekarang: Bpk. Drs. Wittono, M.Pd.